高校生・夜神月（やがみ ライト）は、死神・リュークが落としたデスノートを手に入れる。犯罪者の存在しない理想の新世界を作るため、月は、世界中の犯罪者の名を次々とノートに書き込んで葬っていく。やがてその存在に気付いた大衆は殺し屋（＝Killer） の意味から「キラ (KIRA)」と呼び始め、キラを「神」と崇拝する者まで現れた。自らの行為を正義と信じる月は、新世界の神として世界を意のままに操っていく。 一方、キラの存在を察したICPO（インターポール）は、手がけた事件は必ず解決に導くとされる「L（エル）」と呼ばれる謎の探偵にキラ事件の調査を依頼。Lは全世界の警察を意のままに動かせる唯一の存在であり、その本名はおろか、居場所や顔も性別も一切謎に包まれている。 キラを「悪」と見なすLは綿密な方法で「キラが日本の関東地区にいること」を証明し、日本に捜査本部を設け、キラに挑む。こうして二人はお互いの正体を暴く為に、それぞれの正義を掲げて対決することになる。

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第1話　新生

第2話　対決

第3話　取引

第4話　追跡

第5話　駆引

第6話　綻び

第7話　曇天

第8話　目線

第9話　接触

第10話　疑惑

第11話　突入

第12話　恋心

第13話　告白

第14話　友達

第15話　賭け

第16話　決断

第17話　執行

第18話　仲間

第19話　松田

第20話　姑息

第21話　活躍

第22話　誘導

第23話　狂騒

第24話　復活

第25話　沈黙

第26話　再生

第27話　誘拐

第28話　焦燥

第29話　父親

第30話　正義

第31話　移譲

第32話　選択

第33話　嘲笑

第34話　虎視